Los insectos que afectan el cultivo de papayo pueden ocasionarle pérdidas desde un 5 hasta un 100 % si no son controlados a tiempo. Algunos de ellos no viven en la planta, sino que se les encuentra en la maleza y sólo ocasionalmente, se alimentan en el papayo (áfidos y trips).

Los nemátodos encuentran en las raíces del papayo un huésped perfecto. Desafortunadamente, contrario a los problemas por plagas antes mencionados que con prácticas agrícolas y agroquímicos se evitan o controlan, su principal problema es que no tiene ningún mecanismo de defensa contra el virus de la mancha anular, el cual una vez que infecta a la planta se propaga rápidamente, por medio de vectores del orden Homóptera.

El control químico en papayo requiere de extremo cuidado, ya que algunos insecticidas pueden ocasionar síntomas de fitotoxicidad que semejan a los causados por las enfermedades virales.